Theo quyết định này, KKT Vân Phong có diện tích khoảng 150.000 ha. Trong đó, phần mặt nước khoảng 79.178 ha, phần đất liền và đảo khoảng 70.822 ha.
KKT Vân Phong gồm toàn bộ diện tích tự nhiên các xã Vạn Thạnh, Vạn Thọ, Đại Lãnh, Vạn Phước, Vạn Bình, Vạn Long, Vạn Khánh, Vạn Thắng, Vạn Phú, Vạn Lương, Vạn Hưng và thị trấn Vạn Giã (thuộc huyện Vạn Ninh) và các phường Ninh Hiệp, Ninh Giang, Ninh Đa, Ninh Thủy, Ninh Diêm, Ninh Hải và các xã Ninh An, Ninh Thọ, Ninh Phước (thuộc thị xã Ninh Hòa).
Cảng tổng hợp Bắc Vân Phong hiện đã đi vào hoạt động
Căn cứ điều kiện tự nhiên và yêu cầu phát triển của từng khu vực, KKT Vân Phong được chia thành 19 phân khu chức năng gồm: Khu vực Bán đảo Hòn Gốm và Đảo Hòn Lớn có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 14.756 ha gồm các phân khu: (1) Khu du lịch sinh thái Đảo Hòn Lớn, (2) Khu du lịch Núi Khải Lương; (3) Trung tâm cảng biển – đô thị Đầm Môn; (4) Khu đô thị, du lịch Vĩnh Yên – Mũi Đá Son; (5) Khu đô thị, thương mại, dịch vụ du lịch Tuần Lễ – Hòn Ngang.
Khu vực Cổ Mã – Tu Bông có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 16.589 ha gồm các phân khu: (6) Khu du lịch Đảo Điệp Sơn; (7) Khu đô thị sinh thái Đại Lãnh; (8) Khu đô thị, du lịch Cổ Mã – Tu Bông; (9) Khu du lịch sinh thái núi Tây Tu Bông.
Khu vực Vạn Giã và vùng phụ cận có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 24.229 ha gồm các phân khu: (10) Khu sinh thái núi Tây Vạn Giã; (11) Khu đô thị Vạn Giã và vùng phụ cận; (12) Khu đô thị Nam Vạn Giã; (13) Khu công nghiệp, đô thị dịch vụ Vạn Hưng.
Khu vực Nam Vân Phong đang được đầu tư phát triển về công nghiệp
Khu vực Đông – Bắc Ninh Hòa cỏ tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 7.021 ha gồm các phân khu: (14) Khu đô thị du lịch Ninh Hải – Dốc Lết; (15) Khu dịch vụ đô thị, công nghiệp Tây Ninh An; (16) Khu dịch vụ đô thị và dân cư Đông Bắc Ninh Hòa.
Khu vực Đông – Nam Ninh Hòa có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 12.373 ha gồm các phân khu: (17) Khu đô thị và công nghiệp Bắc Hòn Hèo; (18) Khu đô thị dịch vụ trung tâm Ninh Hòa; (19) Khu chức năng công nghiệp và cảng biển Nam Vân Phong.
Khu vực biển Đại Lãnh (huyện Vạn Ninh)
KKT Vân Phong cũng được định hướng để trở thành khu vực phát triển đô thị thông minh bền vững với hệ thống cơ sở hạ tầng kinh tế – xã hội phát triển đồng bộ, hiện đại; có vị trí quan trọng về an ninh, quốc phòng của quốc gia. Về dân số, đến năm 2030 khoảng 350.000 – 380.000 người, đến năm 2040 khoảng 500.000 – 550.000 người.
Về cảng biển, các trung tâm dịch vụ hậu cần, logistic khoảng 509 ha; các khu vực dự kiến phát triển cảng, hậu cần cảng khoảng 961 ha tại Bắc và Nam Vân Phong. Các khu vực dự kiến phát triển hậu cần cảng, logistics tại Ninh Phước khoảng 445 ha.
Đáng chú ý, khu vực dự kiến phát triển cảng hàng không khoảng 500 ha tại xã Vạn Thắng, huyện Vạn Ninh – khu vực phía Bắc Vân Phong.